⑴现在，所有的基地都做好了准备，面对恐怖分子你的任务是再次领导超级防线的联合部队，铲除叛徒罗曼先生，发布：蓝色警戒的命令!!!联合部队在你的指挥下成功的挫败了敌人的反叛行动，所有的军事基地有回到了超级防线的控制下，保护着地球的和平和繁荣!不久，新得问题产生了恐怖主义!!!
⑵庞大的爆炸场面全三维场景大量空中作战单位横行战场。战争中，空中打击力量举足轻重，显示自然的FX设计使硝烟和战火更逼真，每一关开始时生动的场景动画
⑶经过几个世纪不断地奋斗战争和混乱，人类终于联合起来建立了七大洲联合同盟――UFSC。同盟中的每一个成员国必须建立一个单独的军事团体，以此来保卫地球，捍卫和平。这样所有的成员国就会为了一个共同的目标而努力了，不会再为他们的个自的利益而争斗。
⑷在几年的时间内，UFCS创建了一个全球的防御网络系统――“超级防线”。事实上它是一个高级的智能计算机――由上百个科学家管理着。它由智能软件控制，并由个军事基地组成。这样，机器就不再是人为控制的了。但是，要运行“超级防线”必须经过UFCS的每一个代表的同意。
⑸可是，这样全球人民没有应尽的义务，人们的精神极度空虚，于是出现了很多可以寄托人们精神追求的组织，其中最有影响力的是BEHO-SUNNS 。
⑹这群信徒的领导者们用他们各自的魅力和似是而非的华丽演说去吸引越来越多的人。他们的忠实信徒渗透到了工人科学家政治家和律师及其他更广泛的领域。但是，在背后却隐藏着想得到“超级防线”的邪恶计划。没有一个BEHO-SUNNS的信徒知道在他们做礼拜时，他们的领导者暗中搜集了他们的思想。几年后，BEHO-SUNNS发现了大量关于超级防线的内部结构，于是他们决定开始实施他们的计划了…... 这样，战争就爆发了。BEHO-SUNNS的领导者们企图仅用广泛的防火墙保护就吞掉超级防线，但是他们失败了。结果是毁灭性的。全球的防御系统都发生了故障。
⑺BEHO-SUNNS的人们很快从失败中恢复过来，开始侵占无防备的军事基地。必须阻止他们!为了阻止他们，U.F.S.C.开始发动了"蓝色警戒"......